Antiepileptik ilaç etken maddelerinin yapı-aktivite ilişkilerinin moleküler kenetleme yöntemi ile araştırılması

Abstract

Bu tez çalışmasında epilepsi hastalığında nöbetleri konvülze edebilme özelliği olan 19 adet ilaç etken maddeleri üzerinde ve 5 adet pdb (4KFM, 4PA6, 5UN1, 6HUJ, 6KZP) dosyasıyla çalışılmıştır. Ligandlar belirlenirken epilepsi nöbetinde konvülzant etkisine göre seçilmiştir. Çalışılan 5 adet pdb dosyası nörötransmitter görevi görmektedir. Ve makromoleküller seçilirken eksitatör ve inhibitör etkilere göre belirlenmiştir. Etken maddelerimizle nörotiransmitterlere, moleküler kenetleme (docking) yöntemi ile kenetlenme çalışması yapılmıştır. Tez çalışmasında Autodock Vina programının arayüzü Autodock Tolls programı kullanılmıştır Discovery Studio programı ile optimize edilen yapılar gerekli formatlara dönüştürülmüş ve Autodock Tolls programı ile grid çalışmaları yapılarak afiniteleri belirlenmiştir ve ligandlara herbir reseptör için ayrı ayrı kenetleme işlemi uygulanmıştır. Bulunan sonuçlara göre; vigabatrin, lokosamidin, zonisamid, levetiresetam, trimethadion için en iyi moleküler kenetleme sonucunu 6HUJ makromolekülü vermiştir. Tiagabin, topiramat, felbamat, valproik asit için en iyi değeri 5UN1 makromolekülü vermiştir. Okskarbazepin için en iyi değeri 5UN1 VE 6KZP makromolekülü vermiştir. Lamotrigin için en iyi değeri 5UN1 VE 6HUJ makromolekülü vermiştir. Ethosuximide çin en iyi değeri 4PA6 ve 5UN1 makromolekülü vermiştir. Gabapentin, mesuximide, ethotoin, fenitoin, remasemid, mephenytoin için 4PA6 makromolekülü en iyi değeri vermiştir. Primidon için en iyi bağlanma değerini 6KZP makromolekülü vermiştir. Reseptörler için ise; 4KFM makromolekülü için en iyi değeri fenitoin, 4PA6 makromolekülü için en iyi değeri fenitoin, 5UN1 makromolekülü için tiagabin, 6HUJ makromolekülü için tiagabin ve 6KZP makromolekülü için okskarbazepin makromolekülü göstermiştir. Uygulanan çalışmanın verilerine bakıldığında anlamlı sonuçlar bulunduğunu söyleyebiliriz ancak epilepsi tedavisi için daha çok çalışılması gerekmektedir.