Koc spermasında fertilite ile ilişkili olan oar-mir-133, oar-mir-433-3p, oar-mir-150 ve oar-mir-376d'nin farklılasmis gen ifadesi

Abstract

Koç fertilitesi, koyun üretim sistemlerinde üreme verimliliğinin kritik bir belirleyicisidir, ancak erkek fertilitesinin moleküler mekanizması henüz tam olarak anlaşılamamıştır. Küçük kodlama yapmayan RNA'lar (sncRNA'lar), özellikle mikro RNA'lar (miRNA'lar), spermatogenez, sperm fonksiyonu ve erken embriyonik gelişimin temel epigenetik düzenleyicileri olarak tanınmıştır. Dört spesifik miRNA'nın, yani oar-miR-133 (log2FC = +3.30, p < 0.001), oar-miR-433-3p (log2FC = +5.72, p < 0.001), oar-miR-150 HF (log2FC = -3.49, p < 0.001) ve oar-miR-376d (log2FC = -5.74, p < 0.001) ram sperm fertilite fenotipleriyle ilişkili olarak farklı ifade seviyeleri ve biyolojik önemlerini araştırmayı amaçladık. Yüksek fertiliteden (HF; n = 4; ort. %99.2 gebelik) ve düşük fertiliteden (LF; n = 4; ort. %73.6 gebelik) koçların spermatozoa'ları arasındaki karşılaştırmayı yapan daha önce yayımlanmış küçük RNA dizileme veri setinde istatistiksel olarak anlamlı farklı ifade seviyelerine dayalı olarak seçim yaptık. Biz, oar-miR-133 ve oar-miR-433-3p'nin HF koçlarında önemli ölçüde yukarıregüle olduğunu, oar-miR-150 ve oar-miR-376d'nin ise aşağıregüle olduğunu gösterdik. Tahmin edilen hedef genlerinin fonksiyonel zenginlik analizi, heterokromatin oluşumu, hücresel stres ve sitokinlere yanıt, makromolekül metabolizmasının düzenlenmesi ve gelişim süreçleri gibi biyolojik süreçlere katılımı ortaya koydu. Maksimal Clique Merkeziliği (MCC) kullanarak yapılan protein-protein etkileşim (PPI) ağ analizi, DICER1, DROSHA, DDX10, TUFM ve EEF2 gibi birkaç merkezi merkez genini tanımladı. Merkezi genlerin RNA metabolizması, mitokondriyal fonksiyon ve sperm bütünlüğü ve döllenme kapasitesi için kritik çeviri kontrol süreçleri ile ilişkili olabileceğini gösterdik. Bu sonuçlar, belirli miRNA'ların ve gen ağlarının koç fertilitesi için biyomarker olarak potansiyelini vurgulamaktadır.