Kastamonu Devlet Hastanesi Yoğun Bakım Ünitelerinden İzole Edilen Pseudomonas Aeruginosa Suşlarının Beta-Laktam Antibiyotiklere Duyarlılıklarının Araştırılması

Abstract

Pseudomonas aeruginosa, antibiyotiklere karşı sahip olduğu çeşitli direnç mekanizmaları ile özellikle yoğun bakım hastalarında ciddi sorunlara yol açabilen bir mikrobiyal etkendir. Beta-laktam grubu antibiyotikler P. aeruginosa enfeksiyonlarının tedavisinde en çok tercih edilen moleküllerden biridir. Ancak, bu moleküllere karşı kontrolsüz ve yanlış antibiyotik kullanımı ya da tedavi sırasında ortaya çıkan mutasyonlar neticesinde bakteriler tarafından direnç gelişebilmektedir. Antibiyotik direncinin meydana gelmesi, tedavinin başarısızlıklarla sonuçlanarak ekonomik kayıpların meydana gelmesine hatta hastanın hayatını kaybetmesine neden olabilmektedir. P. aeruginosa’da beta-laktam antibiyotiklere farklı mekanizmalar ile direnç gelişimi olur ve beta-laktamaz enzimlerinden kaynaklı direnç gelişimi P. aeruginosa’da en sık görülen direnç mekanizmasıdır. P. aeruginosa’da beta-laktam grubu antibiyotiklere karşı direnç gelişiminde rol oynayan temel mekanizmanın belirlenmesi çalışılan bölgeye epidemiyolojik bir veri sağlaması ve bölgedeki klinisyenlerin tedavide hangi antibiyotiği seçeceği konusunda yol göstermesi açısından önem arz eder. Literatürde, çeşitli klinik örneklerden izole edilen P. aeruginosa suşlarının beta-laktam antibiyotiklere direncin tespit edilmesi, direnç gelişiminde sorumlu mekanizmanın saptanmasına yönelik çalışmalar vardır. Ancak, ilimiz devlet hastanesini temsil eden bir veri bulunmamaktadır. Bu çalışmada Kastamonu Devlet Hastanesi yoğun bakım ünitesinde yatan hastalardan izole edilecek P. aeruginosa suşlarının beta-laktam antibiyotiklere duyarlılığının ve beta-laktamaz enzimlerini kodlayan genlerin araştırılması amaçlanmıştır. Bu amaç doğrultusunda Kastamonu Devlet Hastanesi Mikrobiyoloji laboratuvarına yoğun bakım ünitelerinden gelecek hasta örneklerinden izole edilecek yaklaşık 100 farklı P. aeruginosa izolatının otomatize sistemler ile beta-laktam antibiyotiklere duyarlılık profilleri belirlenecek ve bunlardan DNA izolasyonu yapılarak bazı beta-laktamaz enzimlerini kodlayan genlerin varlığı konvansiyonel PCR yöntemi ile taranacaktır. Bu projede suşların toplanması ve antibiyotik duyarlılık profillerinin ortaya konması Kastamonu Devlet Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında gerçekleşecektir. Suşların DNA izolasyonu ve direnç genlerinin taranması üniversitemizin Mühendislik ve Mimarlık Fakültesi, Genetik ve Biyomühendislik Bölümünde gerçekleşecektir. Projenin 24 ayda tamamlanması planlanmaktadır. İlk 12 ay sarf, kimyasal malzeme, teçhizat alımı ve suşların toplanması; ikinci 12 ayda suşlardan DNA izolasyonu ve genlerin taranması, verilerin analizi ve sonuç raporunun yazılması planlanmaktadır. Bu proje tamamlandığında, literatüre epidemiyolojik bir veri sağlamasının yanı sıra kurulması planlanan laboratuvarımıza bir alt yapı teşkil etmesi beklenmektedir.