Yayın: BEYAZ PEYNİR MİKROBİYOTASINDA KÜLTÜROMİK VE SHOTGUN METAGENOMİK TEKNOLOJİLERİN DEĞERLENDİRİLMESİ
| dc.contributor.author | CERİT, Zeynep | |
| dc.contributor.author | BALOĞLU, Mehmet Cengiz | |
| dc.contributor.author | YILMAZ, Remziye | |
| dc.date.accessioned | 2026-01-04T15:22:01Z | |
| dc.date.issued | 2021-05-15 | |
| dc.description.abstract | Omik teknolojiler; DNA, RNA, genler, proteinler ve metabolitlerin araştırılması için kullanılan araçlar ve metotlardan oluşan sistematik yöntemler bütünüdür. Son yıllarda mikroorganizmaların tanımlanmasında ve işlevlerinin belirlenmesinde genomik, transkriptomik, proteomik ve metabolomik alanlarda yapılan çalışmalar artış göstermektedir. Genomik ve transkritptomik çalışmalar kapsamında mikroorganizmaların genom dizilerinin belirlenmesinde ve gen ifade analizlerinde yeni nesil dizileme sistemleri ile biyoinformatik araçlar birlikte kullanılmaktadır. Bu çalışmada, beyaz peynirin taşıdığı toplam mikrobiyel yükün oluşturduğu beyaz peynir mikrobiyotasının belirlenmesinde, kültürden bağımsız bir yöntem olan shotgun metagenomik ile kültüre dayalı bir yöntem olan ve mikroorganizmaların tanımlanmasına olanak sağlayan kültüromik metotları üzerinde durulmuştur. Çalışma ile yakın gelecekte beyaz peynir gibi geleneksel gıda ürünlerinin yeni teknikler değerlendirilerek araştırılması gerekliliğinin önemi vurgulanmıştır. Kültüromik, metagenomik gibi yenilikçi teknikler, geleneksel gıda ürünlerinin mikrobiyota tanımlanması üzerinde daha az belirsizlik ile çalışılmasına olanak sağlayabilmektedir. | |
| dc.description.uri | https://doi.org/10.15237/gida.gd20136 | |
| dc.description.uri | https://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/1331598 | |
| dc.description.uri | https://dx.doi.org/10.15237/gida.gd20136 | |
| dc.description.uri | https://dergipark.org.tr/tr/pub/gida/issue/61205/806631 | |
| dc.identifier.doi | 10.15237/gida.gd20136 | |
| dc.identifier.endpage | 582 | |
| dc.identifier.issn | 1300-3070 | |
| dc.identifier.openaire | doi_dedup___::b5c18d9769dbb0c2c79fa094b2854a76 | |
| dc.identifier.orcid | 0000-0003-3955-9584 | |
| dc.identifier.orcid | 0000-0003-2976-7224 | |
| dc.identifier.orcid | 0000-0003-2041-1205 | |
| dc.identifier.startpage | 566 | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12597/38775 | |
| dc.identifier.volume | 46 | |
| dc.publisher | Association of Food Technology, Turkey | |
| dc.relation.ispartof | Gıda | |
| dc.rights | OPEN | |
| dc.subject | white cheese | |
| dc.subject | microbiota | |
| dc.subject | omic technologies | |
| dc.subject | metagenomics | |
| dc.subject | culturomics | |
| dc.subject | MALDI-TOF MS | |
| dc.subject | Food Engineering | |
| dc.subject | beyaz peynir | |
| dc.subject | mikrobiyota | |
| dc.subject | omik teknolojiler | |
| dc.subject | metagenomik | |
| dc.subject | kültüromik | |
| dc.subject | MALDI-TOF MS | |
| dc.subject | Gıda Mühendisliği | |
| dc.subject.sdg | 2. Zero hunger | |
| dc.title | BEYAZ PEYNİR MİKROBİYOTASINDA KÜLTÜROMİK VE SHOTGUN METAGENOMİK TEKNOLOJİLERİN DEĞERLENDİRİLMESİ | |
| dc.type | Article | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| local.api.response | {"authors":[{"fullName":"Zeynep CERİT","name":"Zeynep","surname":"CERİT","rank":1,"pid":{"id":{"scheme":"orcid_pending","value":"0000-0003-3955-9584"},"provenance":null}},{"fullName":"Mehmet Cengiz BALOĞLU","name":"Mehmet Cengiz","surname":"BALOĞLU","rank":2,"pid":{"id":{"scheme":"orcid","value":"0000-0003-2976-7224"},"provenance":null}},{"fullName":"Remziye YILMAZ","name":"Remziye","surname":"YILMAZ","rank":3,"pid":{"id":{"scheme":"orcid","value":"0000-0003-2041-1205"},"provenance":null}}],"openAccessColor":"gold","publiclyFunded":false,"type":"publication","language":{"code":"und","label":"Undetermined"},"countries":null,"subjects":[{"subject":{"scheme":"SDG","value":"2. Zero hunger"},"provenance":null},{"subject":{"scheme":"FOS","value":"0301 basic medicine"},"provenance":null},{"subject":{"scheme":"FOS","value":"0303 health sciences"},"provenance":null},{"subject":{"scheme":"FOS","value":"03 medical and health sciences"},"provenance":null},{"subject":{"scheme":"keyword","value":"white cheese;microbiota;omic technologies;metagenomics;culturomics;MALDI-TOF MS"},"provenance":null},{"subject":{"scheme":"keyword","value":"Food Engineering"},"provenance":null},{"subject":{"scheme":"keyword","value":"beyaz peynir;mikrobiyota;omik teknolojiler;metagenomik;kültüromik;MALDI-TOF MS"},"provenance":null},{"subject":{"scheme":"keyword","value":"Gıda Mühendisliği"},"provenance":null}],"mainTitle":"BEYAZ PEYNİR MİKROBİYOTASINDA KÜLTÜROMİK VE SHOTGUN METAGENOMİK TEKNOLOJİLERİN DEĞERLENDİRİLMESİ","subTitle":null,"descriptions":["<jats:p xml:lang=\"tr\">Omik teknolojiler; DNA, RNA, genler, proteinler ve metabolitlerin araştırılması için kullanılan araçlar ve metotlardan oluşan sistematik yöntemler bütünüdür. Son yıllarda mikroorganizmaların tanımlanmasında ve işlevlerinin belirlenmesinde genomik, transkriptomik, proteomik ve metabolomik alanlarda yapılan çalışmalar artış göstermektedir. Genomik ve transkritptomik çalışmalar kapsamında mikroorganizmaların genom dizilerinin belirlenmesinde ve gen ifade analizlerinde yeni nesil dizileme sistemleri ile biyoinformatik araçlar birlikte kullanılmaktadır. Bu çalışmada, beyaz peynirin taşıdığı toplam mikrobiyel yükün oluşturduğu beyaz peynir mikrobiyotasının belirlenmesinde, kültürden bağımsız bir yöntem olan shotgun metagenomik ile kültüre dayalı bir yöntem olan ve mikroorganizmaların tanımlanmasına olanak sağlayan kültüromik metotları üzerinde durulmuştur. Çalışma ile yakın gelecekte beyaz peynir gibi geleneksel gıda ürünlerinin yeni teknikler değerlendirilerek araştırılması gerekliliğinin önemi vurgulanmıştır. Kültüromik, metagenomik gibi yenilikçi teknikler, geleneksel gıda ürünlerinin mikrobiyota tanımlanması üzerinde daha az belirsizlik ile çalışılmasına olanak sağlayabilmektedir.</jats:p>"],"publicationDate":"2021-05-15","publisher":"Association of Food Technology, Turkey","embargoEndDate":null,"sources":["Crossref","Volume: 46, Issue: 3 566-582","1300-3070","1309-6273","The Journal of Food","Gıda"],"formats":["application/pdf"],"contributors":null,"coverages":null,"bestAccessRight":{"code":"c_abf2","label":"OPEN","scheme":"http://vocabularies.coar-repositories.org/documentation/access_rights/"},"container":{"name":"Gıda","issnPrinted":"1300-3070","issnOnline":null,"issnLinking":null,"ep":"582","iss":null,"sp":"566","vol":"46","edition":null,"conferencePlace":null,"conferenceDate":null},"documentationUrls":null,"codeRepositoryUrl":null,"programmingLanguage":null,"contactPeople":null,"contactGroups":null,"tools":null,"size":null,"version":null,"geoLocations":null,"id":"doi_dedup___::b5c18d9769dbb0c2c79fa094b2854a76","originalIds":["10.15237/gida.gd20136","50|doiboost____|b5c18d9769dbb0c2c79fa094b2854a76","3155404724","50|tubitakulakb::045ab3221bf56ea550221ab598b01107","oai:dergipark.org.tr:article/806631"],"pids":[{"scheme":"doi","value":"10.15237/gida.gd20136"}],"dateOfCollection":null,"lastUpdateTimeStamp":null,"indicators":{"citationImpact":{"citationCount":0,"influence":2.5349236e-9,"popularity":1.6119823e-9,"impulse":0,"citationClass":"C5","influenceClass":"C5","impulseClass":"C5","popularityClass":"C5"}},"instances":[{"pids":[{"scheme":"doi","value":"10.15237/gida.gd20136"}],"type":"Article","urls":["https://doi.org/10.15237/gida.gd20136"],"publicationDate":"2021-05-15","refereed":"peerReviewed"},{"pids":[{"scheme":"doi","value":"10.15237/gida.gd20136"}],"license":"CC BY NC ND","type":"Article","urls":["https://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/1331598"],"refereed":"nonPeerReviewed"},{"alternateIdentifiers":[{"scheme":"doi","value":"10.15237/gida.gd20136"},{"scheme":"mag_id","value":"3155404724"}],"type":"Article","urls":["https://dx.doi.org/10.15237/gida.gd20136"],"refereed":"nonPeerReviewed"},{"alternateIdentifiers":[{"scheme":"doi","value":"10.15237/gida.gd20136"}],"type":"Article","urls":["https://dergipark.org.tr/tr/pub/gida/issue/61205/806631"],"publicationDate":"2020-12-07","refereed":"nonPeerReviewed"}],"isGreen":false,"isInDiamondJournal":false} | |
| local.import.source | OpenAire |
