Yrd. Doç Dr. Ayşegül BACAKSIZ Doç. Dr. Hale ŞAMLIÖZGÖZ, Asuman2024-01-282024-01-28https://hdl.handle.net/20.500.12597/18250Meme kanseri ve diğer maligniteler hücre büyümesi ve gelişimine katılan önemli hücresel yolları etkileyen genetik değişimler ile çok adımlı bir işlem sonucu ortaya çıkar Ülkemizde meme kanseri %24,96 oranıyla kadınlarda görülen kanserler arasında birinci sıradadır. Kadınların meme kanserine yakalanma riski oldukça yüksek olup bir çok faktör meme kanseri riskini artırmaktadır. Düşük-penetranslı yatkınlık genlerinin çevresel ve kalıtsal faktörlerle birleştiğinde, karsinogenez için önemli olduğu ortaya konmuştur. Son zamanlarda, artan bir listeyle Düşük-penetranslı yatkınlık genlerinde veya kromozomal lokuslarda bulunan yaygın SNP’ler genome-wide asosiasyon çalışmalarında (GWAS) tanımlanmış ve meme kanseriyle asosiasyonları bildirilmiştir: FGFR2, LSP1, MAP3K1, TGFB1, TOX3, 2q35 ve 8q’daki lokuslar buna örnektir. GWAS’larda belirlenen meme kanseri riskiyle asosiye SNP’ler pek çok çalışmada ortaya konmasına rağmen Türk toplumunda bildiğimiz kadarıyla bu konuda FGFR2 dışında çalışma bulunmamaktadır. FGFR2, B7-H4, MAP3K1, TOX3, LSP1, ERBB4, SLC4A7 gen varyantlarının Türk meme kanserli hastalarda çalışılması değerli bilgiler ortaya koyacaktır. Biz bu çalışmada FGFR2, B7-H4, MAP3K1, TOX3, LSP1, ERBB4, SLC4A7 geni polimorfizmlerini Bursa Acıbadem Hastanesi Tıbbi Onkoloji Bölümüne başvuran 100 meme kanserli hasta ve 100 benzer yaş aralığındaki sağlıklı kontrol grubunda MALDI-TOF yöntemiyle belirleyeceğiz. Nükleik asitlerin hızlı analizi için MALDI-TOF kütle spektrometrisi, farklı ağırlıklardaki DNA kütlelerinin analizine dayanarak genotipleri ayırt etmeye yarayan bir araç olarak geliştirilmiştir. Bu işlem Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight kütle spektrometrisi’ne (MALDI-TOF) dayanmaktadır. Kısaca, lazer enerjisi matriks tarafından absorblanır, bunun sonucunda minimal hasar ve fragmentasyonla substratın kısmi buharlaşması meydana gelir. İyonize örnekler elektrostatik hızla mass-to-charge oranının saptanması için kütle spekrometresine transfer edilir. Hasta ve kontrol grubundan EDTA’lı tüplere kan alınacak, alınan kanlardan DNA izolasyonu yapıldıktan sonra FGFR2, B7-H4, MAP3K1, TOX3, LSP1, ERBB4, SLC4A7 geni polimorfizmleri MALDI-TOF yöntemiyle belirlenip, elde edilen sonuçlar değerlendirilecektir. Yapılacak çalışmanın 12 ay sürmesi planlanmaktadır. Anahtar Kelimeler: FGFR2, B7-H4, MAP3K1, TOX3, LSP1, ERBB4, SLC4A7, Polimorfizm